Ф.И.О.
Супрун Иван Иванович
Ученая степень
• кандидат биологических наук
Ученое звание
—
Почетное звание
—
Организация, должность
• Всероссийский научно-исследовательский институт риса
старший научный сотрудник
Научные интересы
Молекулярная генетика риса, ДНК-маркирование, ДНК-маркерная селекция риса на устойчивость к пирикуляриозу.
Адрес веб-сайта
—
Электропочта
Текущий рейтинг (суммарный рейтинг статей)
0
TOP5 соавторов
Статей в журнале: 22 шт
Сформировать список работ, опубликованных в Научном журнале КубГАУ
-
Краткое описание
Генетические исследования абрикоса обыкновенного являются актуальным направлением в генетике плодовых культур. В связи с этим пополнение коллекции SSR-маркеров для генотипирования данной культуры является объективно значимой задачей. Была проведена апробация 16 SSR-маркеров, созданных ранее на миндале обыкновенном (PdUnchar2, PdSLD1, PdGMGT1, PdTrTFGT1, PdUnchar2, PdSLD1, PdGMGT1, PdTrTFGT1) и абрикосе сибирском (A3-72, A1-63, H2-22, A3-7-1, H2-5, A1-7, A3-9, H2-45), с целью оценки перспективности их применения для генотипирования сортов абрикоса обыкновенного. Оценка маркеров, проведенная на 3-х сортах различного происхождения, выявила маркеры и их комбинации оптимальные для их применения. В процессе исследования все апробированные SSR-маркеры были объединены в мультиплексные наборы, сформированные из 4 маркеров каждый. Это дает возможность осуществлять генотипирование по 4 маркерам при проведении единичной ПЦР. Один маркер (PdUnchar2) из исследованной выборки включенный в мультиплексный набор не дал амплификации. Пять маркеров дали мономорфный продукт. Остальные 11 SSR маркеров позволили получить полиморфные сортоспецифичные SSR-фингерпринты для всех изученных сортов. Полученные в работе мультиплексные наборы будут применены в исследовательской практике, связанной с изучением полиморфизма сортов абрикоса обыкновенного
-
Краткое описание
В настоящей статье приведены результаты апробации IRAP ДНК-маркеров Cass1 и Cass2 применительно к виду Prunus spinosa. Полученные данные позволяют говорить о высокой перспективности их использования для изучения генетического разнообразия генофонда данного вида. По результатам анализа выборки, из 12 генотипов было идентифицировано от 6 до 13 фрагментов в спектре по маркеру Cass1 и от 5 до 11 фрагментов по маркеру Cass2. В результате кластерного анализа в изученной выборке сформировалось три группы образцов. В одну из групп, наиболее удаленную от двух остальных, вошли образцы, отобранные в Украине, в то время как две оставшиеся группы включили образцы из Армении, Краснодарского края, республики Адыгея, Волгоградской области, и три культурные крупноплодные формы. Распределение образцов по кластерам соответствовал их географическому происхождению, что свидетельствует в пользу объективности оценки генетических дистанций между образцами с использованием маркеров Cass1 и Cass2. Сделан вывод о перспективности использования данных ДНК-маркеров для изучения генетического разнообразия вида Prunus spinosa
-
Краткое описание
Промышленное садоводство предполагает максимально эффективное использование биологического потенциала культивируемых сортов. Одним из ключевых факторов, определяющим урожайность садовых насаждений является эффективность опыления. Для получения максимального урожая необходимо обеспечение полноценного опыления в период цветения. По этой причине вопросу подбора опылителей уделяется большое внимание. Некоторые кребы достаточно перспективны для использования в качестве опылителей для основных промышленных сортов яблони и создания односортных насаждений, поэтому данная работа была направлена на идентификацию наиболее распространенных аллелей гена самонесовместимости у кребов с использованием молекулярно-генетического метода анализа. Объектом исследования послужили 27 кребов и 2 элитные селекционные формы яблони. Выполняли молекулярно-генетическую идентификацию аллелей S2 и S10, которые относятся к числу наиболее распространенных в мировом генофонде яблони. Аллель S2 идентифицировался у 14 образцов (13 кребов и 1 элитной селекционной формы), в то время как аллель S10 у одного образца (элитной формы 12/2- 20-(24-28)). Данные по аллельному составу S-гена у изученных образцов представляют ценность для формирования генетического паспорта по совместимости изученных образцов яблони с современными промышленными сортами
-
Краткое описание
Промышленное яблоневое садоводство связано с определенными рисками, существенным из которых является потери урожая в результате болезней. Наибольший урон приносит парша яблони, вызываемая Venturia inaequalis (Cooke) G. Winter. Приоритетным направлением в контроле парши яблони является создание устойчивых к патогену сортов. В настоящей работе была проведена оценка на искусственном инфекционном фоне семей сеянцев, полученных от свободного опыления шести форм дикой яблони Malus orientalis из коллекции МОС ВИР (Майкоп) характеризующихся относительной устойчивостью к парше яблони на 2–3 балла по многолетним данным. Для заражения использовали составной инокулюм, содержащий как естественную популяцию парши, так и коллекционные штаммы патогена различного сортового и географического происхождения. При проведении дополнительного заражения было отмечено повышение силы инфекционного фона, которое может быть связано с приспособлением инокулюма патогена к относительно устойчивым генотипам растений. Рекомендовано для точной выбраковки неустойчивых растений при отборе на ранних этапах онтогенеза проводить более одного последовательного заражения за сезон. По результатам искусственного инфекционного фона были отмечены три формы яблони восточной из шести изученных № 17982, 17985 и 3080, наиболее перспективных для интрогрессии генов устойчивости в культурный генофонд яблони
-
ДНК-паспортизация современных российских сортов риса с применением SSR-маркеров
Краткое описание
В ходе исследования было выполнено генотипирование 22 отечественных сортов риса современной селекции с использованием микросателлитных ДНК-маркеров. ДНК-маркеры проявили различный уровень полиморфизма – от двух до восьми аллелей на локус. Для всех изученных сортов получены уникальные SSR- профили
-
Модифицированный протокол выделения РНК из зрелых листьев винограда для проведения ОТ-ПЦР
Краткое описание
Выделение высококачественной РНК из тканей многолетних древесных растений, в том числе и винограда, представляет большую сложность в связи с высоким содержанием фенольных соединений, вторичных метаболитов и полисахаридов и рибонуклеазной активностью разрушенных тканей. Большинство методов требуют больших временных или финансовых затрат, либо не дают воспроизводимого результата в случае работы со зрелыми тканями винограда. Был разработан протокол выделения на основе комбинирования и модификации известных методов экстракции РНК с учетом особенностей зрелых тканей винограда. Коммерческие наборы для выделения РНК из тканей растений показали невысокую эффективность экстракции РНК из зрелых тканей винограда, прежде всего связанную с «сортовой спецификой». Воспроизводимые результаты при экстрагировании РНК показывал CTAB-метод, но он имел ряд недостатков: длительность и сложность обработки препарата РНК ДНК-азой. Разработанный метод основан на повышении концентрации меркаптоэтанола и поливинилпирролидона в экстрагирующем буфере, исключении этапа селективного осаждения РНК LiCl и замене его на осаждение на мембране на основе силики (SiO2) с последующей обработкой ДНК-азой, Данные модификации в два раза сокращают временные затраты на выделение РНК и повышают чистоту препарата РНК от геномной ДНК в сравнении с исходной методикой. Данное решение позволяет получать воспроизводимые количество и качество РНК для последующего синтеза кДНК и RT-PCR
-
Апробация метода SSR-анализа для ДНК-паспортизации коммерческих штаммов винных дрожжей
Краткое описание
В ходе исследований была выполнена апробация метода ДНК-анализа для генотипирования некоторых коммерческих штаммов винных дрожжей с использованием микросателлитных последовательностей генома. В работе были апробированы 5 полиморфных SSR-маркеров на выборке из 15 дрожжевых препаратов. Апробированные SSR-маркеры показали высокий уровень информативности и могут быть использованы для анализа генетического разнообразия винных дрожжей
-
Краткое описание
В ходе работы была проведена оценка 33 ISSR маркеров на эффективность использования в выявлении генетических изменений в регенерантах подснежника Воронова (Galanthus woronowii Losinsk..).Установлено 10 маркеров перспективных для проведения генотипирования по исследуемому виду. По пяти маркерам из отобранных десяти был проведен анализ выборки из 20 растений- регенерантов и маточного растения. Полученные данные свидетельствуют о генетической стабильности растительного материала в процессе микроклонального размножения
-
Апробация SSR-маркеров вида Prunus persica для генотипирования сливы домашней
Краткое описание
Микросателлитные ДНК-маркеры в настоящее время эффективно используются при изучении генетического разнообразия генофонда плодовых культур и при ДНК-паспортизации сортов. Для сливы домашней в настоящее время достаточно лимитирован перечень работ, посвященных разработке ДНК-маркеров такого типа. Чаще всего поиск новых SSR-маркеров для данного вида осуществляется путем оценки кросс- воспроизводимости маркеров, разработанных на других видах рода Prunus. В ходе исследования, для 18 SSR-маркеров, ранее разработанных на персике, была выполнена апробация и оценка перспективности использования для генотипирования вида слива домашняя. Апробация, выполненная на 4-х генетически удаленных сорта, принадлежащих к 4-м разным подвидам сливы домашней, показала эффективность их использования. В ходе исследваония все апробированные ДНК-маркеры были сгруппированы в мультиплексные наборы, включающие 3-4 маркера. Это позволяет проводить генотипирование одновременно по 3-4 локусам при постановке одной реакции. Данные мультиплексные наборы предлагаются для использования в изучении генетического полиморфизма вида Prunus domestica L
-
Апробация мультиплексного SSR- анализа для ДНК-паспортизации сортов риса
Краткое описание
В настоящей статье приведены результаты апробации мультиплексных наборов SSR-маркеров для генотипирования сортов риса. Были сформированы два набора SSR-маркеров, включающие в сумме 7 маркеров: 1: RM1+ RM11+ RM70+RM122; 2: RM164+RM167+RM168. Оптимальные сочетания ДНК-маркеров в наборах и условия ПЦР позволили получать точные, легко интерпретируемые результаты при выполнении фрагментного анализа на автоматическом генетическом анализаторе ABIprism3130. С использованием мультиплексных наборов было выполнено генотипирование ряда отечественных сортов риса и сорта ИР-36 селекции Международного научно-исследовательского института риса. Для всех изученных сортов были получены специфичные SSR-фингерпринты. Маркер RM168 у отечественных сортов проявил низкий уровень полиморфизма - один аллель 97 п.н. Однако, при этом, у сорта ИР-36, селекции Международного научно-исследовательского института риса по данному локусу идентифицировался второй тип аллеля 107 п.н.. Кроме того, по локусам RM1, RM11, RM167 и RM164 данный сорт имеет уникальные аллели, Это согласуется со значительными генетическими различиями данного сорта и остальных сортов из изученной выборки. Предложенные мультиплексы перспективны для использования в ДНК- паспортизации сортов и оценке генетического разнообразия
pdf 227.780kb
doc 227.780kb