Ф.И.О.
Супрун Иван Иванович
Ученая степень
• кандидат биологических наук
Ученое звание
—
Почетное звание
—
Организация, должность
• Всероссийский научно-исследовательский институт риса
старший научный сотрудник
Научные интересы
Молекулярная генетика риса, ДНК-маркирование, ДНК-маркерная селекция риса на устойчивость к пирикуляриозу.
Адрес веб-сайта
—
Электропочта
Текущий рейтинг (суммарный рейтинг статей)
0
TOP5 соавторов
Статей в журнале: 22 шт
Сформировать список работ, опубликованных в Научном журнале КубГАУ
-
Краткое описание
В ходе выполнения исследований был выполнен анализ аллельного полиморфизма гена самонесовместимости груши у востребованных в производстве и селекции современных сортов груши из коллекции генетических ресурсов СКЗНИИСиВ. На первом этапе работы использовали консенсусные праймеры PycomC1F и PycomC5R. С учетом полученных данных, после идентификации аллелей у изученных сортов с применением консенсусных праймеров, был проведен анализ с применением аллель специфичных S5 и S8 ДНК-маркеров, подтвердивший наличие/отсутствие данных аллелей у изученных сортов
-
Краткое описание
Целью исследования являлась апробация IRAP маркеров, разработанных на сливе домашней, на сортах персика, сливы русской и алычи и проведение генотипирования отечественных и зарубежных сортов сливы домашней, c последующим анализом полученных данных. В ходе апробации маркеров был выявлен высокий уровень полиморфизм как между генотипами сливы домашней, так и между исследуемыми видами. На основе результатов генотипирования 15 образцов косточковых культур была выполнена кластеризация, определившая три группы генотипов, соответствующих сортам персика, сортам сливы домашней и общая группа для сортов сливы русской и алычи
-
Краткое описание
В ходе работы была проведена оценка 33 ISSR маркеров на эффективность использования в выявлении генетических изменений в регенерантах подснежника Воронова (Galanthus woronowii Losinsk..).Установлено 10 маркеров перспективных для проведения генотипирования по исследуемому виду. По пяти маркерам из отобранных десяти был проведен анализ выборки из 20 растений- регенерантов и маточного растения. Полученные данные свидетельствуют о генетической стабильности растительного материала в процессе микроклонального размножения
-
Краткое описание
В ходе исследований, было апробировано 11 ISSR ДНК-маркеров. Выполнена оценка перспективности их использования для выполнения ДНК - фингерпринтинга редких и исчезающих видов Западного Кавказа, таких как Lilium Caucasicum Miscz. Ex Grossh., Galánthus woronowii Kolak., Pancratium maritimum L. Был выявлен ряд маркеров, перспективных для дальнейшего использования генотипировании целевых видов
-
Апробация SSR-маркеров вида Prunus persica для генотипирования сливы домашней
Краткое описание
Микросателлитные ДНК-маркеры в настоящее время эффективно используются при изучении генетического разнообразия генофонда плодовых культур и при ДНК-паспортизации сортов. Для сливы домашней в настоящее время достаточно лимитирован перечень работ, посвященных разработке ДНК-маркеров такого типа. Чаще всего поиск новых SSR-маркеров для данного вида осуществляется путем оценки кросс- воспроизводимости маркеров, разработанных на других видах рода Prunus. В ходе исследования, для 18 SSR-маркеров, ранее разработанных на персике, была выполнена апробация и оценка перспективности использования для генотипирования вида слива домашняя. Апробация, выполненная на 4-х генетически удаленных сорта, принадлежащих к 4-м разным подвидам сливы домашней, показала эффективность их использования. В ходе исследваония все апробированные ДНК-маркеры были сгруппированы в мультиплексные наборы, включающие 3-4 маркера. Это позволяет проводить генотипирование одновременно по 3-4 локусам при постановке одной реакции. Данные мультиплексные наборы предлагаются для использования в изучении генетического полиморфизма вида Prunus domestica L
-
Апробация метода SSR-анализа для ДНК-паспортизации коммерческих штаммов винных дрожжей
Краткое описание
В ходе исследований была выполнена апробация метода ДНК-анализа для генотипирования некоторых коммерческих штаммов винных дрожжей с использованием микросателлитных последовательностей генома. В работе были апробированы 5 полиморфных SSR-маркеров на выборке из 15 дрожжевых препаратов. Апробированные SSR-маркеры показали высокий уровень информативности и могут быть использованы для анализа генетического разнообразия винных дрожжей
-
Краткое описание
В ходе исследований было выполнено генотипирование некоторых коммерческих штаммов винных дрожжей с использованием анализа Inter-delta последовательностей генома. Оптимизировали экспериментальные параметры ПЦР идентификации и определили оптимальную упрощенную методику экстракции ДНК из высушенных препаратов культур дрожжей. Апробированный метод показал высокий уровень информативности и может быть использован для анализа генетического разнообразия винных дрожжей в сочетании с SSR-маркерами
-
Апробация микросателлитных ДНК-маркеров для идентификации клоновых форм сортов яблони
Краткое описание
В результате проведенной работы была выполнена апробация ряда микросателлитных ДНК-маркеров для идентификации геномного полиморфизма между сортами яблони Флорина, Голден Делишес и их клоновыми формами. При высоком уровне межсортового полиморфизма, изученные ДНК-маркеры не выявили аллельных различий между сортами и их клоновыми формами
-
Апробация мультиплексного SSR- анализа для ДНК-паспортизации сортов риса
Краткое описание
В настоящей статье приведены результаты апробации мультиплексных наборов SSR-маркеров для генотипирования сортов риса. Были сформированы два набора SSR-маркеров, включающие в сумме 7 маркеров: 1: RM1+ RM11+ RM70+RM122; 2: RM164+RM167+RM168. Оптимальные сочетания ДНК-маркеров в наборах и условия ПЦР позволили получать точные, легко интерпретируемые результаты при выполнении фрагментного анализа на автоматическом генетическом анализаторе ABIprism3130. С использованием мультиплексных наборов было выполнено генотипирование ряда отечественных сортов риса и сорта ИР-36 селекции Международного научно-исследовательского института риса. Для всех изученных сортов были получены специфичные SSR-фингерпринты. Маркер RM168 у отечественных сортов проявил низкий уровень полиморфизма - один аллель 97 п.н. Однако, при этом, у сорта ИР-36, селекции Международного научно-исследовательского института риса по данному локусу идентифицировался второй тип аллеля 107 п.н.. Кроме того, по локусам RM1, RM11, RM167 и RM164 данный сорт имеет уникальные аллели, Это согласуется со значительными генетическими различиями данного сорта и остальных сортов из изученной выборки. Предложенные мультиплексы перспективны для использования в ДНК- паспортизации сортов и оценке генетического разнообразия
-
Видовое многообразие микрофлоры на ягодах винограда
Краткое описание
Во многих винодельческих странах на ягодах винограда идентифицировано большое разнообразие микроорганизмов. Это дрожжи различных семейств, видов и родов, бактерии, плесневые грибы. В статье представлены результаты исследования видового состава микрофлоры ягод белых и красных сортов винограда, произрастающего в различных хозяйствах Краснодарского края и Республике Абхазия. Для выявления всего спектра дрожжей проводили посевы на элективные среды. Выросшие колонии после предварительного микроскопирования выделяли в культуры и подвергали тестированию по культурально- морфологическим признакам, руководствуясь определителями и пособиями. Установлено видовое разнообразие микрофлоры на поверхности ягод винограда всех исследованных сортов, независимо от места их произрастания. Полученные данные показали, что группа дрожжей, постоянно присутствующая в комплексе эпифитных микроорганизмов винограда- Saccharomyces, Pichia, Hansenula, Hanseniаspora была характерна для всех сортов винограда во всех исследованных регионах. Показана гетерогенность таксонометрического состава микрофлоры. Превалировали дрожжи семейства Saccharomycetaceae, вид Saccharomyces vini. Количество дрожжей Saccharomyces vini уменьшается в ряду Мысхако > Кавказ > Фанагория, что в целом согласуется с климатическими условиями. Только на сорте винограда Пино нуар идентифицированы дрожжи Brettanomyces Dekkera. На ягодах сортов винограда Каберне и Карабурну обнаружены дрожжи Schisosaccharomyces acidodevoratus, вызывающие кислотопонижение. На ягодах винограда, произраставшего в ОАО АПФ «Фанагория» не выявлено наличие молочнокислых бактерий Lactobacillus brevis и дрожжей вида Schisosaccharomyces acidodevoratus. В этом же хозяйстве отмечено наименьшее количество дрожжей-вредителей видов Pichia и Candida. В микрофлоре винограда сортов винограда Каберне, Рислинг и, особенно, Карабурну, представлены молочнокислые бактерии Lactobacillus plantarum и Lactobacillus brevis. Lactobacillus plantarum. Среди бактерий общее количество кокковой флоры составляет - 56 %, палочковидной - 44 %. Идентифицированы два вида жизнедеятельных уксуснокислых бактерий – Acetobacter aceti и Acetobacter xelinum. Особенно высокой была их концентрация на поверхности ягод винограда сорта Качич
pdf 807.365kb
doc 807.365kb